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血漿樣本基孔肯雅病毒全基因組測(cè)序測(cè)試

原創(chuàng)發(fā)布者:北檢院    發(fā)布時(shí)間:2025-07-22     點(diǎn)擊數(shù):

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注意:因業(yè)務(wù)調(diào)整,暫不接受個(gè)人委托測(cè)試望見諒。

信息概要

血漿樣本基孔肯雅病毒全基因組測(cè)序測(cè)試是一種通過高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)血漿中的基孔肯雅病毒進(jìn)行全基因組分析的檢測(cè)服務(wù)。該檢測(cè)能夠準(zhǔn)確識(shí)別病毒基因組序列,為病毒溯源、變異監(jiān)測(cè)、流行病學(xué)調(diào)查以及疫苗和藥物研發(fā)提供關(guān)鍵數(shù)據(jù)。檢測(cè)的重要性在于能夠幫助公共衛(wèi)生部門及時(shí)掌握病毒變異情況,指導(dǎo)疫情防控策略,并為臨床診斷和治療提供科學(xué)依據(jù)。

檢測(cè)項(xiàng)目

病毒RNA提取, 基因組文庫(kù)構(gòu)建, 高通量測(cè)序, 序列質(zhì)量控制, 基因組組裝, 變異位點(diǎn)分析, 系統(tǒng)發(fā)育分析, 同源性比對(duì), 開放閱讀框預(yù)測(cè), 基因注釋, 進(jìn)化樹構(gòu)建, 重組分析, 毒力基因檢測(cè), 耐藥性分析, 宿主互作預(yù)測(cè), 抗原表位預(yù)測(cè), 轉(zhuǎn)錄本分析, 拷貝數(shù)變異檢測(cè), 基因組完整性評(píng)估, 污染篩查

檢測(cè)范圍

基孔肯雅病毒亞洲株, 基孔肯雅病毒非洲株, 基孔肯雅病毒印度洋株, 基孔肯雅病毒東非株, 基孔肯雅病毒西非株, 基孔肯雅病毒歐洲株, 基孔肯雅病毒美洲株, 基孔肯雅病毒東南亞株, 基孔肯雅病毒南亞株, 基孔肯雅病毒中東株, 基孔肯雅病毒大洋洲株, 基孔肯雅病毒加勒比株, 基孔肯雅病毒南美株, 基孔肯雅病毒北美株, 基孔肯雅病毒東亞株, 基孔肯雅病毒太平洋島株, 基孔肯雅病毒印度株, 基孔肯雅病毒巴西株, 基孔肯雅病毒哥倫比亞株, 基孔肯雅病毒秘魯株

檢測(cè)方法

RNA提取:使用磁珠法或柱式法從血漿樣本中提取病毒RNA。

逆轉(zhuǎn)錄PCR:將病毒RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA并進(jìn)行擴(kuò)增。

文庫(kù)構(gòu)建:使用轉(zhuǎn)座酶法或PCR擴(kuò)增法構(gòu)建測(cè)序文庫(kù)。

高通量測(cè)序:采用Illumina或Nanopore平臺(tái)進(jìn)行全基因組測(cè)序。

序列質(zhì)量控制:通過FastQC等工具評(píng)估測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量。

基因組組裝:使用SPAdes或Canu等軟件進(jìn)行基因組拼接。

變異位點(diǎn)分析:通過GATK或VarScan檢測(cè)基因組變異。

系統(tǒng)發(fā)育分析:使用MEGA或BEAST構(gòu)建進(jìn)化樹。

同源性比對(duì):通過BLAST或Bowtie比對(duì)參考基因組。

基因注釋:使用Prokka或RAST進(jìn)行基因功能預(yù)測(cè)。

進(jìn)化樹構(gòu)建:基于最大似然法或貝葉斯法構(gòu)建進(jìn)化關(guān)系。

重組分析:使用RDP或SimPlot檢測(cè)基因組重組事件。

毒力基因檢測(cè):通過數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)識(shí)別毒力相關(guān)基因。

耐藥性分析:比對(duì)已知耐藥突變位點(diǎn)預(yù)測(cè)耐藥性。

宿主互作預(yù)測(cè):使用STRING或Cytoscape分析病毒與宿主互作網(wǎng)絡(luò)。

檢測(cè)儀器

Nanodrop分光光度計(jì), Qubit熒光定量?jī)x, 離心機(jī), PCR儀, 電泳儀, 凝膠成像系統(tǒng), Illumina測(cè)序儀, Nanopore測(cè)序儀, 生物分析儀, 磁珠分離儀, 核酸提取儀, 恒溫混勻儀, 超低溫冰箱, 超凈工作臺(tái), 實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀

實(shí)驗(yàn)儀器

實(shí)驗(yàn)室儀器 實(shí)驗(yàn)室儀器 實(shí)驗(yàn)室儀器 實(shí)驗(yàn)室儀器

測(cè)試流程

血漿樣本基孔肯雅病毒全基因組測(cè)序測(cè)試流程

注意事項(xiàng)

1.具體的試驗(yàn)周期以工程師告知的為準(zhǔn)。

2.文章中的圖片或者標(biāo)準(zhǔn)以及具體的試驗(yàn)方案僅供參考,因?yàn)槊總€(gè)樣品和項(xiàng)目都有所不同,所以最終以工程師告知的為準(zhǔn)。

3.關(guān)于(樣品量)的需求,最好是先咨詢我們的工程師確定,避免不必要的樣品損失。

4.加急試驗(yàn)周期一般是五個(gè)工作日左右,部分樣品有所差異

5.如果對(duì)于(血漿樣本基孔肯雅病毒全基因組測(cè)序測(cè)試)還有什么疑問,可以咨詢我們的工程師為您一一解答。

  • 服務(wù)保障 一對(duì)一品質(zhì)服務(wù)
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